La historia sigue a Ken Kaneki, un estudiante universitario que apenas sobrevive a un encuentro mortal con Rize Kamishiro, su cita que se revela como un ghoul. Lo llevan al hospital en estado crítico. Después de recuperarse, Kaneki descubre que se sometió a una cirugía que lo transformó en medio demonio.
Esto se logró porque algunos de los órganos de Rize fueron transferidos a su cuerpo, y ahora, como los demonios normales, debe consumir carne humana para sobrevivir. Los demonios que administran la cafetería "Anteiku" lo acogen y le enseñan a lidiar con su nueva vida como medio demonio.
Algunas de sus luchas diarias incluyen encajar en la sociedad ghoul, así como mantener su identidad oculta a sus compañeros humanos, especialmente a su mejor amigo Hideyoshi Nagachika.
La serie precuela Tokyo Ghoul [Jack] sigue a los jóvenes de Kish? Arima y Taishi Fura, dos personajes de la serie principal que se conocen cuando unen fuerzas para investigar la muerte del amigo de Taishi por las manos de un ghoul, lo que lleva a que Taishi finalmente lo siga En el camino de Arima y uniéndose a la CCG (Comisión de Counter Ghoul), la agencia federal también se encargó de tratar crímenes relacionados con ghouls.
La serie secuela Tokyo Ghoul: re sigue a un Kaneki amnésico bajo la nueva identidad de Haise Sasaki (el resultado del horrible daño cerebral sufrido por Kish? Arima).
Es el mentor de un equipo especial de investigadores de CCG llamado "Quinx Squad" que se sometió a un procedimiento similar al suyo, permitiéndoles obtener las habilidades especiales de Ghouls para luchar contra ellos, pero aún así poder vivir como humanos normales.
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